Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sin3aQ60520 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sin3aQ60520 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms