Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms