Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NacadQ5SWP3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms