Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh2Q5SW75 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ssh2Q5SW75 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ssh2Q5SW75 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ssh2Q5SW75 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh2Q5SW75 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh2Q5SW75 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms