Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ggnbp2Q5SV77 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms