Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms