Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Utp18Q5SSI6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Utp18Q5SSI6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms