Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnf215Q5SPX3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnf215Q5SPX3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms