Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc88aQ5SNZ0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms