Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Trappc1Q5NCF2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms