Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnni3kQ5GIG6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms