Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Snx25Q3ZT31 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx25Q3ZT31 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Snx25Q3ZT31 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snx25Q3ZT31 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx25Q3ZT31 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.8 ms