Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrc43Q3V0L5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Lrrc43Q3V0L5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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