Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp48Q3V0C5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Usp48Q3V0C5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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