Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ttc9Q3V038 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms