Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnpc3Q3UZ01 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms