Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28047Q3US59 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28047Q3US59 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms