Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms