Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Skap2Q3UND0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms