Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hdgfl2Q3UMU9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdgfl2Q3UMU9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Hdgfl2Q3UMU9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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