Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc34Q3UI66 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms