Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3j1Q3UGC7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Eif3j1Q3UGC7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms