Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nom1Q3UFM5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nom1Q3UFM5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms