Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE70

Gm21748, Predicted gene, 21748, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21748Q3UE70 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21748Q3UE70 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21748Q3UE70 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21748Q3UE70 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21748Q3UE70 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21748Q3UE70 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms