Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Parp8Q3UD82 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms