Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gtpbp6Q3U6U5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gtpbp6Q3U6U5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms