Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LcorlQ3U285 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms