Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Palb2Q3U0P1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms