Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Trappc9Q3U0M1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms