Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Srsf6Q3TWW8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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