Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Fndc4Q3TR08 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fndc4Q3TR08 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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