Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms