Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RubcnlQ3TD16 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms