Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hddc2Q3SXD3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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