Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gbp8Q2V6D6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms