Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms