Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Shroom4Q1W617 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Shroom4Q1W617 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Shroom4Q1W617 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Shroom4Q1W617 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Shroom4Q1W617 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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