Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Samd11Q1RNF8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Samd11Q1RNF8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms