Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Trim71Q1PSW8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Trim71Q1PSW8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms