Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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ptchd1Q14B62 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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ptchd1Q14B62 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ptchd1Q14B62 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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