Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VgfQ0VGU4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms