Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Itgb8Q0VBD0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms