Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spata18Q0P557 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms