Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TrioQ0KL02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms