Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rbp2Q08652 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms