Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc4Q08624 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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