Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Calb2Q08331 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Calb2Q08331 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms