Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Siah1bQ06985 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms