Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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Sh3bp2Q06649 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp2Q06649 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms