Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Prrx2Q06348 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prrx2Q06348 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms